กติกาจะคล้ายคลึงกับ ศึกวันดวลเพลง สงครามแชมป์ ในปีที่แล้ว แต่จะต่างจากปีที่แล้วตรงที่ ทางรายการจะจับฉลากประกบคู่กลางรายการ โดยแชมป์ที่จำนวนสมัยน้อยที่สุด 2 อันดับในแต่ละสาย จะทำการประกบคู่ โดยในฉลากจะเป็นชื่อแชมป์ที่จำนวนสมัยสูงสุด 2 อันดับ ในแต่ละสายเช่นกัน และการแข่งขันในแต่ละรอบ ทางรายการจะทำการจับฉลากเพื่อทำการร้องก่อนหลังทุกรอบเสมอ และเพื่อความยุติธรรมของการแข่งขัน ทางรายการจะมีสิทธิ์เตรียมเพลงมาใช้ในการแข่งขันในแต่ละรอบได้คนละ 3 เพลงเท่านั้น แต่รอบรองชนะเลิศและรอบชิงชนะเลิศผู้เข้าแข่งขันจะต้องเตรียมเพลงที่จะใช้ในการแข่งขันทั้งหมด 4 เพลง

รอบรองชนะเลิศ

ในรอบนี้ แชมป์ทั้ง 3 กลุ่ม และ แชมป์เก่า ศึกวันดวลเพลง สงครามแชมป์ ฤดูกาลที่ 1 จะต้องทำการแข่งขันในรูปแบบ พบกันหมด โดยใครชนะรับไปเลยแมทช์ละ 1 คะแนน โดยหลังจบ 6 แมทช์ ผู้เข้าแข่งขันคนใดสะสมคะแนนได้สูงสุด 2 อันดับ จะผ่านเข้าสู่รอบชิงชนะเลิศทันที แต่ในกรณีที่สะสมคะแนนเท่ากัน จะนับกันที่ คะแนนจากซองกรรมการ

รอบชิงชนะเลิศ

ในรอบนี้ กติกาจะคล้ายคลึงกับ ศึกวันดวลเพลง เสาร์ ๕ ในรอบ 5 เจ้าสำนัก คือ ผู้เข้าแข่งขัน จะต้องทำการแข่งขันกันทั้งหมด 3 ยก โดยถ้าใครจับฉลากได้ร้องก่อนในยกแรก จะกลับมาร้องหลังในยกที่สอง และกลับมาร้องก่อนในยกที่สาม โดยผู้เข้าแข่งขันคนใดสามารถเอาชนะคู่แข่งได้ 2 ใน 3 ยก ผู้เข้าแข่งขันคนนั้นรับไปเลย 1,000,000 บาท ทันที